• ZIKMUND, T.; ŠALPLACHTA, J.; ZATOČILOVÁ, A.; BŘÍNEK, A.; PANTĚLEJEV, L.; ŠTĚPÁNEK, R.; KOUTNÝ, D.; PALOUŠEK, D.; KAISER, J. Computed tomography based procedure for reproducible porosity measurement of additive manufactured samples. NDT & E INTERNATIONAL, 2019, roč. 103, č. 1, s. 111-118. ISSN: 1879-1174.
  • KALASOVÁ D.; ZIKMUND T., PÍNA L.; TAKEDA Y.; HORVÁTH M.; OMOTE K.; KAISER J. Characterization of a laboratory-based X-ray computed nanotomography system for propagation-based method of phase contrast imaging. IEEE Transactions on Instrumentation and Measurement. 2019.
  • TESAŘOVÁ M.; ZIKMUND T.; KAUCKÁ M.; ADAMEYKO I.; KAISER J. Use of the industrial X-ray computed microtomography to address scientific questions in developmental biology. The e-Journal of Nondestructive Testing, 2019, roč. 24, č. 3, s. 1-9. ISSN: 1435-4934.
  • POSPIECH, M.; ZIKMUND, T.; JAVŮRKOVÁ, Z.; KAISER, J.; TREMLOVÁ, B. An Innovative Detection of Mechanically Separated Meat in Meat Products. FOOD ANAL METHOD, 2019, roč. 1, č. 11, s. 1-6. ISSN: 1936-9751.
  • ŠALPLACHTA, J.; ZIKMUND, T.; HORVÁTH, M., TAKEDA, Y., OMOTE, K., PÍNA, L., KAISER, J. CCD and scientific-CMOS detectors for submicron laboratory based X-ray Computed Tomography. The e-Journal of Nondestructive Testing, 2019, č. 2019, s. 1-8. ISSN: 1435-4934.
  • VOJTOVÁ, L.; ZIKMUND, T.; PAVLIŇÁKOVÁ, V.; ŠALPLACHTA, J.; KALASOVÁ, D.; PROSECKÁ, E.; BRTNÍKOVÁ, J.; ŽÍDEK, J.; PAVLIŇÁK, D.; KAISER, J. The 3D imaging of mesenchymal stem cells on porous scaffolds using high-contrasted x-ray computed nanotomography. Journal of Microscopy, 2019, roč. 273, č. 3, s. 169-177. ISSN: 1365-2818.
  • BLAŽEK, P.; ŠRÁMEK, J.; ZIKMUND, T.; KALASOVÁ, D.; HORTVÍK, V.; KLAPETEK, P.; KAISER, J. Voxel size and calibration for CT measurements with a small field of view. The e-Journal of Nondestructive Testing, 2019, č. 2019, s. 1-7. ISSN: 1435-4934.


  • HEUDE, E.; TESAŘOVÁ, M.; SEFTON, E. M.; JULLIAN, E.; ADACHI, N.; GRIMALDI, A.; ZIKMUND, T.; KAISER, J.; KARDON, G.; KELLY, R. G.; TAJBAKHSH, S. Unique morphogenetic signatures define mammalian neck muscles and associated connective tissues. eLife, 2018, č. 7, s. 1-75. ISSN: 2050-084X.

  • HANKEOVÁ, S.; ZIKMUND, T.; KAVKOVÁ, M.; BŘÍNEK, A.; LENDAHL, U.; KAISER, J.; BRYJA, V.; ANDERSSON, E. Double resin casting micro computed tomography (DUCT) of biliary and vascular system. JOURNAL OF HEPATOLOGY. 2018. s. S414 (S415 s.)ISSN: 0168-8278.

  • SLÁDEK, V.; SABOLOVÁ, V.; ŠEBESTA, O.; ZIKMUND, T.; KAISER, J.; ČEREVKOVÁ, S. Effect of deriving periosteal and endosteal contours from microCT scans on computation of cross-sectional properties in non-adults: the femur. Journal of Anatomy, 2018, roč. 233, č. 3, s. 1-13. ISSN: 1469-7580.

  • ŠŤASTNÝ, P.; CHLUP, Z.; KALASOVÁ, D.; ZIKMUND, T.; KAISER, J.; TRUNEC, M. Epoxy-based gelcasting of machinable hydroxyapatite foams for medical applications. Journal of the American Ceramic Society, 2018, roč. 101, č. 8, s. 3317-3327. ISSN: 0002-7820.

  • ROČŇÁKOVÁ, I.; SLÁMEČKA, K.; MONTUFAR JIMENEZ, E.; REMEŠOVÁ, M.; DYČKOVÁ, L.; BŘÍNEK, A.; JECH, D.; DVOŘÁK, K.; ČELKO, L.; KAISER, J. Deposition of Hydroxyapatite and Tticalcium Phosphate Coatings by Suspension Plasma Spraying: Effects of Torch Speed. Journal of the European Ceramic Society, 2018, č. 38, s. 5489-5496. ISSN: 0955-2219.

  • KALASOVÁ, D.; PAVLIŇÁKOVÁ, V.; ZIKMUND, T.; VOJTOVÁ, L.; KAISER, J. Correlation of X-ray Computed Nanotomography and Scanning Electron Microscopy Imaging of Collagen Scaffolds. MICROSCOPY AND MICROANALYSIS, 2018, roč. 24, č. S2, s. 102-103. ISSN: 1431-9276.

  • TESAŘOVÁ M., MANCINI L., SIMON A., ADAMEYKO I., KAUCKÁ M., ELEWA A., LANZAFAME G., ZHANG Y., KALASOVÁ D., SZAROWSKÁ B., ZIKMUND T., NOVOTNÁ M., KAISER J. A quantitative analysis of 3D-cell distribution in regenerating muscle-skeletal system with synchrotron X-ray computed microtomography. Scientific Reports, 2018, roč. 14145, č. 8, s. 1-13. ISSN: 2045-2322.

  • POSPIECH, M.; ZIKMUND, T.; JAVŮRKOVÁ, Z.; KAISER, J.; TREMLOVÁ, B. An Innovative Detection of Mechanically Separated Meat in Meat Products. FOOD ANAL METHOD, 2018, roč. 1, č. 11, s. 1-6. ISSN: 1936-9751.

  • KAUCKA, M.; PETERSEN, J.; TESAROVA, M.; SZAROWSKA, B.; KASTRITI, ME. ; XIE, M. ; KICHEVA, A. ; ANNUSVER, K. ; PAN, L.; SPITZ, F. ; KAISER, J. ; HOVORAKOVA, M.; ZIKMUND, T.; SUNADOME, K.; MATISE, MP. ; WANG, H.; MARKLUND, U.; ABDO, H.; ERNFORS, P. ; MAIRE, P. ; WURMSER, M. CHAGIN, AS. ; FRIED, K.; ADAMEYKO, I. Signals from the brain and olfactory epithelium control shaping of the mammalian nasal capsule cartilage. eLife, 2018, roč. 7, č. 1, s. e34465 (e34465 s.)ISSN: 2050-084X.

  • KALASOVÁ, D.; DVOŘÁK, K.; SLOBODNÍK, M.; VŠIANSKÝ, D.; ZIKMUND, T.; DLUHOŠ, J.; VÁŇA, R.; BUREŠ, J.; KAISER, J. Characterization of inner structure of limestone by X-ray computed sub-micron tomography. CONSTRUCTION AND BUILDING MATERIALS, 2018, roč. 174, č. 1, s. 693-700. ISSN: 1879-0526.
  • BŘÍNEK, A.; LÁZŇOVSKÝ, J.; LÍZAL, F.; REHÁK, Z.; ZIKMUND, T.; JEDELSNKÝ, J.; KAISER, J. Evaluation of aerosol deposition in a realistic human airway model by X-ray computed tomography/positron emission tomography. The e- Journal of Nondestructive Testing, 2018. ISSN: 1435-4934.
  • ZIKMUND, T.; NOVOTNÁ, M.; KAVKOVÁ, M.; TESAŘOVÁ, M.; KAUCKÁ, M.; SZAROWSKÁ, B.; ADAMEYKO, I.; HRUBÁ, E.; BUCHTOVÁ, M.; DRAŽANOVÁ, E.; STARČUK, Z.; KAISER, J. High-contrast differentiation resolution 3D imaging of rodent brain by X-ray computed microtomography. Journal of Instrumentation, 2018, roč. 13, č. 2, s. 1-12. ISSN: 1748-0221.
  • SEDLAČÍK, T., O. K. ACAR, H. STUDENOVSKÁ, et al. Chondrogenic potential of macroporous biodegradable cryogels based on synthetic poly(α-amino acids). Soft Matter. 2018, 14(2), 228-238. DOI: 10.1039/C7SM02074K. ISSN 1744-683X.
  • MARCIÁN, P.; WOLFF, J.; HORÁČKOVÁ, L.; KAISER, J.; ZIKMUND, T.; BORÁK, L. Micro finite element analysis of dental implants under different loading conditions. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, 2018, č. 96, s. 157-165. ISSN: 0010-4825.


  • PAVLIŇÁKOVÁ, V.; VOJTOVÁ, L.; ŠALPLACHTA, J.; ZIKMUND, T.; PROSECKÁ, E.; ŽÍDEK, J.; KAISER, J. 3D imaging of biopolymeric scaffolds seeded with cells using x-ray computed nano- tomography. Czech Chemical Society Symposium Series. Czech chemical society symposium series. Praha: Czech Chemical Society Symposium Series, 2017. s. 37-38. ISSN: 2336-7202.
  • KALASOVÁ, D.; ZIKMUND, T.; ŠŤASTNÝ, P.; TRUNEC, M.; KAISER, J. Determination of porosity from tomographic data of hydroxyapatite scaffold- like structures. Czech chemical society symposium series. Praha: Czech chemical society, 2017. s. 12-13. ISSN: 2336-7202.
  • ŠŤASTNÝ, P.; TRUNEC, M.; KALASOVÁ, D.; CHLUP, Z.; ZIKMUND, T. Machinable porous hydroxyapatite scaffolds prepared by, gel- casting method using an epoxide as a gelling agent. CEITEC PHD RETREAT II. První. Published by Masaryk University, Brno, Czech, Republic: 2017. s. 108-108. ISBN: 9778-80-210-8550- 3.
  • KALASOVÁ, D.; ZIKMUND, T.; KAISER, J. Computed tomography for inspection of inner structure of materials. In CEITEC PhD retreat II, Telč 20-21 April 2017 – Book of abstracts. 2017. s. 79-79. ISBN: 978-80-210-8550- 3.
  • KAUCKÁ, M.; ZIKMUND, T.; TESAŘOVÁ, M.; GYLLBORG, D.; HELLANDER, A.; JAROŠ, J.; KAISER, J.; PETERSEN, J.; SZAROWSKA, B.; NEWTON, P.T.; DYACHUK, V.; LI, L.; QIAN, H.; JOHANSSON, A-S.; MISHINA, Y.; CURRIE, J.; TANAKA, E.M.; ERICKSON, A.; DUDLEY, A.; BRISMAR, H.; SOUTHAM, P.; COEN, E.; CHEN, M.; WEINSTEIN, L.S.; HAMPL, A.; ARENAS, E.; CHAGIN, A.S.; FRIED, K.; ADAMEYKO, I. Oriented clonal cell dynamics enables accurate growth and shaping of vertebrate cartilage. eLife, 2017, roč. 6, č. 4, s. 1-82. ISSN: 2050-084X.
  • NEUMANNOVÁ Klára, PETŘÍK Jan, VOSTROVSKÁ Ivana, DVOŘÁK Jindřich, ZIKMUND Tomáš, KAISER Jozef. Variability in coiling technique in LBK pottery inferred by experiments and pore structure micro- tomography analysis. Archeologické rozhledy, 2017, roč. 69, č. 1, s. 1-15. ISSN: 0323-1267.
  • KALASOVÁ, D.; MAŠEK, J.; ZIKMUND, T.; SPURNÝ, P.; HALODA, J.; BURGET, R.; KAISER, J. Segmentation of multi- phase object applying trainable segmentation. The e- Journal of Nondestructive Testing, 2017, č. 2017, s. 1-6. ISSN: 1435-4934.
  • Li, L., Newton, P. T., Bouderlique, T., Sejnohova, M., Zikmund, T., Kozhemyakina, E., Xie, M., Krivanek, J., Kaiser, J., Qian, H., Dyachuk, V., Lassar, A. B., Warman, M. L., Barenius, B., Adameyko, I., Chagin, A. S. Superficial cells are self-renewing chondrocyte progenitors, which form the articular cartilage in juvenile mice. The FASEB Journal, 2017, roč. 31, č. 3, s. 1067-1084. ISSN: 0892-6638.
  • LOJDA, V.; ZIKMUND, T.; SOJKA, K.; KAISER, J.; PROŠEK, Z.; LIDMILA, M. Microstructural Analysis of Fly Ash- Based Stabilizer for Track Bed. In Contemporary Materials and Technologies in Civil Engineering. Key Engineering Materials Vol. 731. 2017. s. 66-73. ISBN: 978-3-0357-1138- 7.
  • HORYNOVÁ, M.; CASAS LUNA, M.; MONTUFAR JIMENEZ, E.; DÍAZ DE LA TORRE, S.; ČELKO, L.; KLAKURKOVÁ, L.; DIÉGUEZ-TREJO, G.; DVOŘÁK, K.; ZIKMUND, T.; KAISER, J. Fracture Mechanism of Interpenetrating Iron- Tricalcium Phosphate Composite. In Materials Structure & Micromechanics of Fracture VIII. Solid State Phenomena. Solid State Phenomena. Switzerland: Trans Tech Publications, 2017. s. 333-336. ISBN: 978-3-03835-626- 4. ISSN: 1012-0394.
  • VYMAZALOVA, K.; VARGOVA, L.; ZIKMUND, T.; KAISER, J. The possibilities of studying human embryos and foetuses using micro-CT: a technical note. Anatomical Science International, 2017, roč. 92, č. 2, s. 299-303. ISSN: 1447-073X.
  • KOUTECKÝ, T.; ZIKMUND, T.; GLITTOVÁ, D.; PALOUŠEK, D.; ŽIVČÁK, J.; KAISER, J. X-ray micro- CT measurement of large parts at very low temperature. Review of Scientific Instruments, 2017, roč. 88, č. 3, s. 033707- 1 (033707-6 s.)ISSN: 0034-6748.


  • MONTUFAR JIMENEZ, E.; HORYNOVÁ, M.; CASAS LUNA, M.; DIAZ-DE-LA-TORRE, S.; ČELKO, L.; KLAKURKOVÁ, L.; SPOTZ, Z.; DIÉGUEZ-TREJO, G.; FOHLEROVÁ, Z.; DVOŘÁK, K.; ZIKMUND, T.; KAISER, J. Spark plasma sintering of load-bearing iron-carbon nanotube- tricalcium phosphate CerMets for orthopaedic applications. JOM, 2016, roč. 68, č. 4, s. 1134-1142. ISSN: 1047-4838.
  • TESAŘOVÁ, M.; ZIKMUND, T.; KAUCKÁ, M.; ADAMEYKO, I.; JAROŠ, J.; PALOUŠEK, D.; ŠKAROUPKA, D.; KAISER, J. Use of micro computed- tomography and 3D printing for reverse engineering of mouse embryo nasal capsule. Journal of Instrumentation, 2016, roč. 11, č. 3, s. 1-11. ISSN: 1748-0221.
  • KAISER, J.; ZIKMUND, T. The Dolní Věstonice Studies, Volume 21/ 2016. In The Dolní Věstonice Studies, Volume 21/ 2016. Brno: Academy of Sciences of the Czech Republic, Institute of Archeology, 2016. s. 372-376. ISBN: 978-80-7524-004- 0.
  • ŽÍDEK, J.; VOJTOVÁ, L.; ABDEL-MOHSEN, A.; CHMELÍK, J.; ZIKMUND, T.; BRTNÍKOVÁ, J.; JAKUBÍČEK, R.; ZUBAL, L.; JAN, J.; KAISER, J. Accurate micro-computed tomography imaging of pore spaces in collagen-based scaffold. Journal of Materials Science: Materials in Medicine, 2016, roč. 27, č. 6, s. 1-18. ISSN: 0957-4530.
  • KALASOVÁ, D.; ZIKMUND, T.; JAROŠ, J.; TESAŘOVÁ, M.; KAUCKÁ, M.; ADAMEYKO, I.; PALOUŠEK, D.; ŠKAROUPKA, D.; KAISER, J. Industrial Tomography System for Answering Biological Issues: Development of the, Mouse Embryo Face. In 6th Conference on Industrial Computed Tomography (ICT) 2016. The e- Journal of Nondestructive Testing. iCT 2016, 2016. s. 1-9. ISSN: 1435-4934.
  • M. Kaucka, E. Ivashkin, D. Gyllborg, T. Zikmund, M. Tesarova, J. Kaiser, M. Xie, J. Petersen, V. Pachnis, S.K. Nicolis, T. Yu, P. Sharpe, E. Arenas, H. Brismar, H. Blom, H. Clevers, U. Suter, A.S. Chagin, K. Fried, A. Hellander, I. Adameyko. Analysis of neural crest- derived clones reveals novel aspects of facial development. Science Advances, 2016, roč. 2, č. 8, s. 1-16. ISSN: 2375-2548.
  • ROČŇÁKOVÁ, I.; MONTUFAR JIMENEZ, E.; HORYNOVÁ, M.; ZIKMUND, T.; NOVOTNÝ, K.; KLAKURKOVÁ, L.; ČELKO, L.; SONG, G-L; KAISER, J. Assessment of localized corrosion under simulated physiological conditions of magnesium samples with heterogeneous microstructure: value of X-ray computed micro- tomography platform. CORROSION SCIENCE, 2016, roč. 104, č. 3, s. 187-196. ISSN: 0010-938X.


  • ROČEK, Z.; BOISTEL, R.; LENOIR, N.; MAZURIER, A.; PIERCE, S.; RAGE, J.; SMIRNOV, S.; SCHWERMANN, A.; VALENTIN, X.; VENCZEL, M.; WUTTKE, M.; ZIKMUND, T. Frontoparietal Bone in Extinct Palaeobatrachidae (Anura): Its Variation and Taxonomic Value. Anatomical Record, 2015, vol. 298, no. 11, p. 1848-1863. ISSN: 1932- 8494.
  • KOUKAL, O.; KOUTNÝ, D.; PALOUŠEK, D.; VRÁNA, R.; ZIKMUND, T.; PANTĚLEJEV, L. Research about the Influence of Process Parameters of Selective Laser Melting on Material EN AW 2618. In Euro PM2015 Proceedings. Reims, France: 2015. p. 1-6. ISBN: 978-1-899072-47- 7.
  • KOUTNÝ, D.; PALOUŠEK, D.; KOUKAL, O.; ZIKMUND, T.; PANTĚLEJEV, L.; DOKOUPIL, F. Processing of High Strength Al-Cu alloy Using 400W Selective Laser Melting – Initial Study. In Lasers in Manufacturing 2015 Proceedings. Bochum: German Scientific Laser Society, 2015. p. 1-11.
  • SVOBODA, J.; HLADILOVÁ, Š.; HORÁČEK, I.; KAISER, J.; KRÁLÍK, M.; NOVÁK, J.; NOVÁK, M.; POKORNÝ, P.; SÁZELOVÁ, S.; SMOLÍKOVÁ, L.; ZIKMUND, T. Dolní Věstonice IIa: Gravettian microstratigraphy, environment, and the origin of baked clay production in Moravia. QUATERNARY INTERNATIONAL, 2015, vol. 359- 360, no. 1, p. 195-210. ISSN: 1040- 6182.
  • VRÁNA, R.; KOUTNÝ, D.; PALOUŠEK, D.; ZIKMUND, T. Impact Resistance of Lattice Structure Made By Selective Laser Melting From Alsi12 Alloy. MM Science Journal, 2015, vol. 2015, no. 4, p. 852-855. ISSN: 1805- 0476.
  • MINARIKOVA A., Fictum P., ZIKMUND T., JEKL V. 2016 Dental Disease and Periodontitis in a Guinea Pig (Cavia porcellus). Journal of Exotic Pet Medicine,
  • JEKL V., ZIKMUND T., HAUPTMAN K. 2016 Dyspnea in a degu (Octodon degu) associated with maxillary cheek teeth elongation. Journal of Exotic Pet Medicine, accepted


  • HOBST, L.; BÍLEK, P.; ANTON, O.; ZIKMUND, T. Sledování nepravidelného rozmístění drátků v kalibračních vzorcích drátkobetonu počítačovou tomografií (CT). Materiály pro stavbu, 2014, vol. 2014, no. 5, p. 63-65. ISSN: 1213- 0311.
  • VOJTOVÁ, L.; ŽÍDEK, J.; ZUBAL, L.; BRTNÍKOVÁ, J.; ABDEL-LATTIF, A.; ZIKMUND, T.; PROSECKÁ, E.; RAMPICHOVÁ, M.; CHMELÍK, J.; JAKUBÍČEK, R.; JAN, J.; KAISER, J. Studium morfologie biopolymerních skafoldů pomocí rentgenové počítačové mikro- tomografie. In Programová brožura konference: VIII. česko- slovenská konference Polymery. 1. Praha: ÚMCH AVČR, 2014. p. 23-25. ISBN: 978-80-85009-81- 1.
  • ZIKMUND, T.; BRADA, M.; ZATOČILOVÁ, A.; PETRILAK, M.; KAISER, J. Kontrola rozměrů redukce objektivu a kamery pomocí rentgenové počítačové tomografie. Jemná mechanika a optika, 2014, vol. 59, no. 6- 7, p. 186-189. ISSN: 0447- 6441.
  • BÍLEK, P.; HOBST, L.; ZIKMUND, T. Využití počítačové tomografie pro kontrolu homogenity drátkobetonu. In Sborník příspěvků ExFoS – Expert Forensic Science XXIII. mezinárodní vědecká konference soudního inženýrství. ExFoS. Brno, Česká republika: 2014. p. 37-44. ISBN: 978-80-214-4852- 0.
  • FRIML, J.; PROCHÁZKOVÁ, K.; MELNYK, G.; ZIKMUND, T.; KAISER, J. Investigation of Cheb relief intarsia and the study of the technological process of its production by micro computed tomography. Journal of cultural heritage, 2014, vol. 15, no. 6, p. 609-613. ISSN: 1296- 2074.


  • ZIKMUND, T.; PETRILAK, M.; NOVOTNÝ, J.; LIŠKA, M.; KAISER, J. Kontrola rozměrů koncovky optického vlákna pomocí počítačové tomografie. Jemná mechanika a optika, 2013, vol. 2013, no. 6, p. 181-183. ISSN: 0447- 6441.